如何高效率进行lncRNA-mRNA相关关系研究
由于lncRNA包含很多调控方式，所以lncRNA与mRNA的关联关系也比较多。不同的lncRNA-mRNA关系可能行使不同的功能。两组学之间的关联关系主要有以下3种：
1.Antisense关系
近几年的研究中，反义lncRNA被证实与肺癌、乳腺癌等癌变机制密切相关。反义lncRNA（图1紫色）中有一部分可以与mRNA结合而调控基因沉默、转录及mRNA的稳定性。存在antisense关系的lncRNA与mRNA反向互补，存在不同的链上，影响mRNA的剪切形式。在antisense关系的研究中，我们使用软件预测反义lncRNA与mRNA之间的互补结合的情况，然后根据最小自由能来预测lncRNA与mRNA的最佳碱基配对关系。我们需要注意的是，在我们进行Antisense关系研究时，要选择与mRNA在相反链并且配对结果较好的lncRNA进行后续的研究。
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